• 13e eeuw De ridders van St.Jan bouwden een godshuis dat werd genoemd naar Johannes de Doper, de St Janskerk.
• 1425         Na een brand werd de kerk bijna geheel vernieuwd, kreeg twee torens en werd in 1470 opnieuw ingewijd.
• 1817         De kerk was inmiddels zo bouwvallig dat deze werd afgebroken en de hervormde kerk kreeg toestemming om te bouwen. Daar was veel behoefte aan omdat ongeveer 60% van alle inwoners van Arnhem hervormd was. De Eusebiuskerk kon deze toevloed niet aan. De Koepelkerk werd dan ook jarenlang 'Nieuwe Kerk' genoemd.
• 1837         De eerste steen werd gelegd en Koning Willem I bezocht nog diezelfde week de plaats van bouwen. Het ontwerp kwam van de hand van Anthony Aytinck van Falkenstein en was naar het voorbeeld van de Amsterdamse Koepelkerk.  De bouwstijl is neoclasticistisch.
• jan 1839   De Koepelkerk was gereed en werd ingewijd door ds Donker Curtius. Het gebouw had 900 zitplaatsen. De kerk werd o.a. bezocht door de 'Gele Rijders', soldaten van de rijdende artillerie uit de Willemskazerne.
• 1840         Bouw van het orgel door de orgelbouwers Naber en Quellhorst. 
• 1880         Aanleg gasverlichting.
• 1933         Aanleg verwarming. 
• eind 1944 Het gebouw liep tijdens de Slag om Arnhem een voltreffer op pal boven het orgel. Maandenlang hadden regen en wind vrij spel. Al snel werd met alle macht het gebouw en het orgel gerenoveerd. De galerij op de tweede verdieping werd gesloopt.
• 1948         In gebruikname van het gerestaureerde orgel. 
• aug 1961  Het kerkgebouw werd verkocht aan de Gereformeerde Kerk (vrijgemaakt). 
• 1973         Het orgel heeft een grondige opknapbeurt nodig wat in 3 jaar door vrijwilligers uit de gemeente en firma Reil te Heerde werd uitgevoerd.
• 1976         Het gebouw werd grondig gerenoveerd en gerestaureerd. Het fundament werd 1,5 meter uitgegraven en de vloer van de kerkzaal werd 1,5 meter verhoogd. Zo ontstond onder de kerkzaal een grote gemeenschappelijke ruimte waar nog steeds met veel dankbaarheid gebruik van wordt gemaakt. Ook werd de oorspronkelijke tweede galerij weer aangebracht en kwamen er in de buitenring kleinere vertrekken die nu vooral als vergaderruimtes worden gebruikt. De kerk staat op de monumentenlijst.

 
Het gebouw is rolstoeltoegankelijk.
 
Voor de uitgebreide geschiedenis van het orgel verwijzen we naar de volgende website:
http://home.kpn.nl/ben-walters/orgels/koepelkerk.html